Điều khiển vi sinh vật bằng ánh sáng: Bước ngoặt cho sinh học tổng hợp

Điều khiển vi sinh vật bằng ánh sáng: Bước ngoặt cho sinh học tổng hợp
Sở thích|Phổ biến khoa học chuyên gia

Optogenetics là gì và vì sao men làm bánh bỗng trở nên thú vị?

Optogenetics là công nghệ sinh học sử dụng các bước sóng ánh sáng để bật tắt có chọn lọc các gen trong vi sinh vật biến đổi gen, cho phép con người điều khiển hành vi tế bào với độ chính xác theo thời gian và không gian cao hơn hẳn các phương pháp hóa học truyền thống. Trong nghiên cứu mới, một nhóm nhà khoa học từ Đại học Quốc gia Singapore đã dùng công nghệ optogenetics – vốn được định nghĩa là việc dùng ánh sáng để điều khiển hoạt động tế bào – để biến chủng nấm men làm bánh quen thuộc thành hệ “tế bào lập trình được” phản ứng với nhiều màu ánh sáng khác nhau. Thay vì phải thêm chất cảm ứng nhiều lần, họ cho thấy có thể truyền “mã lệnh sinh học” chỉ bằng cách chiếu các màu và kiểu chớp tắt ánh sáng lên quần thể nấm men, từ đó tái định nghĩa cách chúng ta hiểu về sinh học tổng hợp và sản xuất sinh học.

Từ men làm bánh tới “tế bào biết phân biệt màu”: Đột phá kỹ thuật

Lâu nay, nấm men đã được sinh học tổng hợp khai thác như một vi sinh vật biến đổi gen quan trọng để biến đường thành thuốc, nhiên liệu và hóa chất công nghiệp. Vấn đề là ngay cả những chủng đã được thiết kế tinh vi vẫn khó điều khiển chính xác và kịp thời. Nhóm NUS do Phó giáo sư Poh Chueh-Loo dẫn dắt đã quyết định tấn công vào điểm nghẽn này bằng công nghệ optogenetics, tái “đi dây điện” trong tế bào để các gen mục tiêu có thể bật tắt khi gặp ánh sáng. Đột phá cốt lõi nằm ở việc họ lần đầu tiên tạo ra một chủng nấm men làm bánh có thể cảm nhận và phản hồi với nhiều màu ánh sáng khác nhau, cụ thể là đỏ và xanh lam. Ban đầu, cộng đồng chỉ mới làm nấm men phản ứng với một màu đơn lẻ; giờ đây một chủng duy nhất có hai “kênh màu” độc lập để điều chỉnh biểu hiện gen, mở cánh cửa cho lập trình di truyền đa kênh ngay trong cùng một tế bào.

y-iLight: Vì sao ánh sáng đỏ lại quan trọng đến vậy?

Điểm nghẽn kỹ thuật lớn nhất trước đây là khiến nấm men phản ứng ổn định với ánh sáng đỏ – loại ánh sáng xuyên sâu mô sinh học mà không gây nhiều tổn hại tế bào. Các hệ optogenetics nhạy đỏ sẵn có ở nấm men cần nhiều gen đưa thêm, cofactor phụ hoặc điều kiện thao tác rất cẩn trọng để tránh kích hoạt ngoài ý muốn, nên khó kết hợp với các hệ điều khiển bằng ánh sáng khác. Nhóm NUS đã khéo léo thích nghi một công cụ di truyền nhạy sáng từng dùng trong vi khuẩn và tế bào động vật để tạo ra một protein nhạy ánh sáng đỏ cho nấm men, đặt tên là y-iLight. Khi gặp ánh sáng đỏ, y-iLight gắn vào các trình tự DNA đích và bật các gen được lập trình tương ứng. Quan trọng hơn, hệ này không cần thêm hóa chất ngoài các phân tử vốn đã hiện diện tự nhiên trong nấm men, khiến nền tảng đơn giản, tiết kiệm chi phí và đáng tin cậy hơn cho ứng dụng thực tế.

Điều khiển tế bào bằng ánh sáng: Từ “crosstalk” đến lập trình đa kênh

Ngay cả khi y-iLight ra đời, nó vẫn mắc lỗi “nghe nhầm kênh”: ánh sáng xanh lam cũng có thể kích hoạt hệ nhạy đỏ này. Sự nhiễu chéo đó khiến việc chạy song song hai hệ điều khiển bằng ánh sáng trong cùng một tế bào gần như bất khả thi. Các nhà nghiên cứu đã giải bài toán bằng một chiến lược thiết kế protein dạng mô-đun: họ gắn y-iLight với các mô-đun protein có nhiệm vụ chặn hoạt động của nó riêng dưới ánh sáng xanh, rồi sàng lọc nhiều tổ hợp để tìm biến thể vẫn giữ tốt độ nhạy đỏ nhưng loại bỏ kích hoạt ngoài ý muốn bởi xanh lam. Khi kết hợp hệ đỏ đã tối ưu với hệ nhạy xanh đã biết tên EL222, họ đạt được khả năng điều khiển độc lập hai “kênh biểu hiện gen” trong cùng một chủng nấm men. Theo nhóm tác giả, thành tựu này là bước tiến lớn hướng tới optogenetics đa kênh, nơi màu sắc khác nhau tương đương với các lệnh khác nhau cho tế bào.

Ý nghĩa: Sản xuất sinh học bền vững và thế hệ vi sinh vật lập trình được

Từ góc nhìn sinh học tổng hợp, điều khiển tế bào bằng ánh sáng là thay đổi luật chơi. Thay vì phụ thuộc vào chất cảm ứng hóa học – vốn tốn kém, khó phân bố đều và khó tắt nhanh – các nhà khoa học giờ có thể truyền lệnh động cho nấm men bằng các mẫu nhấp nháy và màu sắc ánh sáng, không cần lặp lại việc thêm hóa chất. Điều này khiến sản xuất sinh học trở nên dễ dự đoán và “lập trình được” hơn nhiều so với phương pháp truyền thống, đúng như nhận định rằng dùng các màu ánh sáng khác nhau để điều khiển quá trình nhiều bước sẽ mở đường cho biomanufacturing có tính dự báo cao và chương trình hóa. Trong ngắn hạn, nền tảng này có thể phục vụ biomanufacturing, tối ưu đường dẫn sinh tổng hợp và thiết kế vật liệu sống. Với độ nhạy mạnh hơn, nhóm tác giả kỳ vọng nó sẽ tạo ra cơ hội mới cho cách vi sinh vật biến đổi gen sản xuất hóa chất và vật liệu giá trị, từ dược phẩm đến công nghệ sinh học bền vững.

Tương lai: Tế bào như “phần cứng sinh học” và cuộc đua thương mại hóa

Điểm hấp dẫn nhất của công nghệ optogenetics nằm ở chỗ nó biến tế bào thành một dạng “phần cứng sinh học” có thể lập trình lại liên tục. Khi ánh sáng đóng vai trò giao diện điều khiển, cùng một chủng nấm men có thể đảm nhiệm nhiều nhiệm vụ khác nhau, chỉ bằng việc đổi màu hoặc mẫu chiếu sáng – điều không thể làm linh hoạt nếu phải thay chất hóa học trong bể nuôi cấy. Nhóm NUS đã công bố kết quả trên một tạp chí khoa học quốc tế vào tháng 5, đồng thời cho biết họ đang tiếp tục thiết kế có chủ đích các mạng gen để tăng cường độ mạnh và độ nhạy của các protein cảm quang. Kế hoạch của họ không dừng ở phòng thí nghiệm: nhóm đang cố gắng đưa công nghệ ra thị trường thông qua việc lập start-up hoặc cấp phép cho đối tác quan tâm. Nếu làm được, chúng ta sẽ tiến gần tới kỷ nguyên nơi ánh sáng không chỉ dùng để chiếu sáng nhà xưởng, mà còn để “lập trình” chính nhà máy vi sinh vật bên trong đó.

Sammfy nhận hoa hồng khi bạn mua sắm qua liên kết của chúng tôi, bạn không phải trả thêm chi phí.

You May Also Like

Comments
Viết gì đó...
Chưa có bình luận nào. Hãy là người đầu tiên chia sẻ suy nghĩ!